MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli IAI39 chromosome

Total Repeats: 90587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011750	CAC	2	6	203	208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698420
2	NC_011750	ACC	3	9	213	221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698420
3	NC_011750	CGG	2	6	352	357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698421
4	NC_011750	CAGG	2	8	418	425	25 %	0 %	50 %	25 %	218698421
5	NC_011750	CT	3	6	443	448	0 %	50 %	0 %	50 %	218698421
6	NC_011750	ACCA	2	8	464	471	50 %	0 %	0 %	50 %	218698421
7	NC_011750	TGG	2	6	474	479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698421
8	NC_011750	GAT	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
9	NC_011750	A	6	6	489	494	100 %	0 %	0 %	0 %	218698421
10	NC_011750	CGC	2	6	568	573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698421
11	NC_011750	TCG	2	6	612	617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
12	NC_011750	TTG	2	6	662	667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698421
13	NC_011750	CGCTG	2	10	691	700	0 %	20 %	40 %	40 %	218698421
14	NC_011750	GC	3	6	752	757	0 %	0 %	50 %	50 %	218698421
15	NC_011750	CTG	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
16	NC_011750	CCG	2	6	847	852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698421
17	NC_011750	CCG	2	6	906	911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698421
18	NC_011750	TGG	2	6	930	935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698421
19	NC_011750	ACT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698421
20	NC_011750	CTG	2	6	963	968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
21	NC_011750	GCTG	2	8	973	980	0 %	25 %	50 %	25 %	218698421
22	NC_011750	TTG	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698421
23	NC_011750	GGAC	2	8	1011	1018	25 %	0 %	50 %	25 %	218698421
24	NC_011750	GTT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698421
25	NC_011750	TTC	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698421
26	NC_011750	TGA	2	6	1231	1236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
27	NC_011750	GGC	2	6	1327	1332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698421
28	NC_011750	GC	3	6	1331	1336	0 %	0 %	50 %	50 %	218698421
29	NC_011750	GTG	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698421
30	NC_011750	ATC	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698421
31	NC_011750	TG	3	6	1433	1438	0 %	50 %	50 %	0 %	218698421
32	NC_011750	AAG	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698421
33	NC_011750	GGT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698421
34	NC_011750	TCT	2	6	1634	1639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698421
35	NC_011750	CGT	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
36	NC_011750	GAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
37	NC_011750	TCA	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698421
38	NC_011750	GCT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
39	NC_011750	GAA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698421
40	NC_011750	GAA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698421
41	NC_011750	ATC	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698421
42	NC_011750	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698421
43	NC_011750	CCAG	2	8	2001	2008	25 %	0 %	25 %	50 %	218698421
44	NC_011750	GTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698421
45	NC_011750	TCG	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
46	NC_011750	TAC	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698421
47	NC_011750	GCG	2	6	2117	2122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698421
48	NC_011750	TGA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
49	NC_011750	TGA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
50	NC_011750	GAT	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
51	NC_011750	ATTGAA	2	12	2429	2440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218698421
52	NC_011750	TGC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
53	NC_011750	CGA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698421
54	NC_011750	CG	4	8	2524	2531	0 %	0 %	50 %	50 %	218698421
55	NC_011750	TGA	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
56	NC_011750	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
57	NC_011750	TAT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218698421
58	NC_011750	GCG	2	6	2862	2867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698422
59	NC_011750	GGC	2	6	2915	2920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698422
60	NC_011750	CAA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698422
61	NC_011750	GGT	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698422
62	NC_011750	ATGA	2	8	3126	3133	50 %	25 %	25 %	0 %	218698422
63	NC_011750	GCA	2	6	3205	3210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698422
64	NC_011750	GGT	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698422
65	NC_011750	TGA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698422
66	NC_011750	GAA	2	6	3264	3269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698422
67	NC_011750	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698422
68	NC_011750	CAGC	2	8	3281	3288	25 %	0 %	25 %	50 %	218698422
69	NC_011750	TGA	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698422
70	NC_011750	CGC	2	6	3384	3389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698422
71	NC_011750	ATTGC	2	10	3394	3403	20 %	40 %	20 %	20 %	218698422
72	NC_011750	TGA	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698422
73	NC_011750	AGCG	2	8	3563	3570	25 %	0 %	50 %	25 %	218698422
74	NC_011750	TCCGGC	2	12	3576	3587	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218698422
75	NC_011750	TG	3	6	3604	3609	0 %	50 %	50 %	0 %	218698422
76	NC_011750	CGG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698422
77	NC_011750	CTGA	2	8	3849	3856	25 %	25 %	25 %	25 %	218698423
78	NC_011750	TGA	2	6	3860	3865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698423
79	NC_011750	TGA	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698423
80	NC_011750	CG	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	218698423
81	NC_011750	CGG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698423
82	NC_011750	GGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698423
83	NC_011750	TGA	3	9	4322	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698423
84	NC_011750	CTA	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698423
85	NC_011750	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	218698423
86	NC_011750	CGG	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698423
87	NC_011750	CTG	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698423
88	NC_011750	ACG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698423
89	NC_011750	AAC	2	6	4650	4655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698423
90	NC_011750	GTT	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698423
91	NC_011750	CCG	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698423
92	NC_011750	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698423
93	NC_011750	AG	3	6	4880	4885	50 %	0 %	50 %	0 %	218698423
94	NC_011750	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698423
95	NC_011750	TGC	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698423
96	NC_011750	TGA	3	9	4999	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698423
97	NC_011750	ATC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698423
98	NC_011750	GCA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698424
99	NC_011750	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698424
100	NC_011750	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698424
101	NC_011750	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698424
102	NC_011750	CGC	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698424
103	NC_011750	ATC	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698424
104	NC_011750	ATC	2	6	5494	5499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698424
105	NC_011750	CAT	2	6	5517	5522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698424
106	NC_011750	GCT	2	6	5573	5578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698425
107	NC_011750	GGA	2	6	5610	5615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218698425
108	NC_011750	TCA	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698425
109	NC_011750	AAG	2	6	5626	5631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698425
110	NC_011750	CAGT	2	8	5651	5658	25 %	25 %	25 %	25 %	218698425
111	NC_011750	AAT	2	6	5685	5690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218698425
112	NC_011750	TCA	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698425
113	NC_011750	TGA	2	6	5732	5737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698425
114	NC_011750	TTC	2	6	5752	5757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698425
115	NC_011750	TTC	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698425
116	NC_011750	CAC	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698425
117	NC_011750	TGC	2	6	5862	5867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698425
118	NC_011750	TTG	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698425
119	NC_011750	TGA	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698425
120	NC_011750	AAATCG	2	12	6037	6048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218698425
121	NC_011750	AGCG	2	8	6155	6162	25 %	0 %	50 %	25 %	218698425
122	NC_011750	GCT	2	6	6245	6250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698425
123	NC_011750	GTG	2	6	6286	6291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698425
124	NC_011750	GCC	2	6	6645	6650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698426
125	NC_011750	GTT	2	6	6699	6704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698426
126	NC_011750	AGA	2	6	6716	6721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698426
127	NC_011750	ATC	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698426
128	NC_011750	CGC	2	6	6987	6992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698426
129	NC_011750	TGCCGC	2	12	6993	7004	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218698426
130	NC_011750	CGC	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698426
131	NC_011750	GCC	2	6	7095	7100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698426
132	NC_011750	GCCA	2	8	7112	7119	25 %	0 %	25 %	50 %	218698426
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262	NC_011750	GGC	2	6	14280	14285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698433
263	NC_011750	GCG	3	9	14290	14298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698433
264	NC_011750	GGC	3	9	14304	14312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698433
265	NC_011750	GGC	2	6	14358	14363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698433
266	NC_011750	GTC	2	6	14371	14376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698433
267	NC_011750	GCG	2	6	14382	14387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698433
268	NC_011750	CG	3	6	14386	14391	0 %	0 %	50 %	50 %	218698433
269	NC_011750	GAA	2	6	14427	14432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698433
270	NC_011750	CTT	2	6	14576	14581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698433
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273	NC_011750	GTCATG	2	12	14650	14661	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218698433
274	NC_011750	GCA	2	6	14674	14679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698433
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276	NC_011750	AAC	2	6	14832	14837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698433
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278	NC_011750	GTC	2	6	15027	15032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698433
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280	NC_011750	CTT	2	6	15137	15142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698433
281	NC_011750	GAA	2	6	15152	15157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698433
282	NC_011750	T	6	6	15159	15164	0 %	100 %	0 %	0 %	218698433
283	NC_011750	GAC	2	6	15165	15170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698433
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285	NC_011750	ATC	2	6	16102	16107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698434
286	NC_011750	TTC	2	6	16118	16123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698434
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290	NC_011750	T	6	6	16461	16466	0 %	100 %	0 %	0 %	218698434
291	NC_011750	TA	3	6	16473	16478	50 %	50 %	0 %	0 %	218698434
292	NC_011750	AATC	2	8	16488	16495	50 %	25 %	0 %	25 %	218698434
293	NC_011750	ACAA	2	8	16523	16530	75 %	0 %	0 %	25 %	218698434
294	NC_011750	TGT	2	6	16547	16552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698434
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300	NC_011750	AAT	2	6	16824	16829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218698435
301	NC_011750	GCC	2	6	16903	16908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698435
302	NC_011750	AAC	2	6	16916	16921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698435
303	NC_011750	TCA	2	6	16931	16936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698435
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330	NC_011750	GGTT	2	8	18641	18648	0 %	50 %	50 %	0 %	218698436
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337	NC_011750	TGA	2	6	18875	18880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698436
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353	NC_011750	AAT	2	6	19471	19476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218698436
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371	NC_011750	CT	3	6	20495	20500	0 %	50 %	0 %	50 %	218698437
372	NC_011750	TG	3	6	20545	20550	0 %	50 %	50 %	0 %	218698437
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376	NC_011750	AGCGA	2	10	20690	20699	40 %	0 %	40 %	20 %	218698437
377	NC_011750	GTGG	2	8	20720	20727	0 %	25 %	75 %	0 %	218698437
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380	NC_011750	GCCTT	2	10	20989	20998	0 %	40 %	20 %	40 %	218698437
381	NC_011750	CGG	2	6	21064	21069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698437
382	NC_011750	CGTT	2	8	21092	21099	0 %	50 %	25 %	25 %	218698437
383	NC_011750	AAG	2	6	21231	21236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698438
384	NC_011750	TTTA	2	8	21264	21271	25 %	75 %	0 %	0 %	218698438
385	NC_011750	ATT	2	6	21328	21333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218698438
386	NC_011750	CGC	2	6	21520	21525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698438
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388	NC_011750	CCAC	2	8	21567	21574	25 %	0 %	0 %	75 %	218698438
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